AHeaD

Évaluer la santé dans un contexte de numérisation du monde réel Pharmacoepi et au-delà

Pr. Antoine Pariente, MD, PhD, Directeur de l’AHEAD
Dr. Gayo DIALLO, PhD, Directeur adjoint de l’AHEAD

Détails

Centre de recherche INSERM U1219
Université de Bordeaux – ISPED case 11
146 rue Léo-Saignat
33076 BORDEAUX cedex

Tél : 05 57 57 95 12

Contact

Marie-Annick Gauvrit

Pr. Antoine Pariente
MD, PhD, Directeur de l'équipe AHeaD

Le Dr Antoine Pariente a obtenu un doctorat en pharmacologie et en santé publique et a complété sa formation par un doctorat en pharmacoépidémiologie axé sur l’impact des médicaments sur la population dans le cas de la démence.

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Pr. Gayo Diallo
PhD, AHeaD Directeur Adjoint

Gayo Diallo est professeur titulaire en informatique à l’Université de Bordeaux (France) depuis 2022 et directeur adjoint du groupe de recherche AHeaD du centre de recherche Bordeaux Santé des Populations (BPH) Inserm-1219.

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Informations Publications

Objectifs

Nous souhaitons mieux comprendre le contexte réel des soins de santé et mieux évaluer les médicaments dans cet environnement d’observation.

En particulier, nous souhaitons étudier les trajectoires de soins et leurs déterminants, avec un intérêt spécifique pour l’utilisation des soins d’urgence d’une part, et les trajectoires de soins pour les patients atteints de maladies chroniques liées à la santé cardiovasculaire ou à la santé mentale d’autre part.

Domaines de recherche

Au cours des cinq dernières années, nous avons fait partie de trois équipes différentes (« Pharmacoepidemiology – Pharmacoepi » ; « Injuries – IETO » ; « Informatics in Health – ERIAS »). Les collaborations que nous avons développées ont finalement concentré la plupart des efforts de recherche de nos équipes, généralement autour de l’utilisation secondaire des bases de données électroniques pour l’étude de la santé et des médicaments dans un contexte réel,

Anticipant les défis de recherche qui émergeront de la multiplication, de la diversification et de la complexification des données numériques de santé, nous avons décidé d’unir nos forces dans le projet d’équipe AHeaD.

Celui-ci combinera l’expertise de nos équipes d’origine en matière de bases de données de dossiers médicaux électroniques (HERs), d’entrepôts de données hospitalières, d’ontologies, de visualisation de données, de représentation des connaissances, d’apprentissage automatique et de traitement du langage naturel pour la recherche en santé, constituant ainsi une formidable opportunité de recherche.

En effet, si les questions et les besoins en matière d’évaluation de la santé dans le monde réel demeureront, la manière d’y répondre changera probablement radicalement. Dans les années à venir, l’utilisation des bases de données électroniques sur la santé, qui se sont considérablement développées au cours des 30 dernières années, devra être complétée par des informations provenant d’autres sources qui contribueront à renforcer et à étayer les preuves fournies dans le monde réel. L’établissement de ponts entre la recherche appliquée en matière de santé, qui utilise déjà largement les DSE, et l’informatique apparaît donc comme une nécessité lorsqu’on envisage le développement futur de l’évaluation de la santé dans des contextes réels.

Domaines de recherche

La recherche se divisera en trois axes correspondant à des objectifs et des méthodes différents :

Données et signaux : Structuration et rapprochement des données pour la génération d’hypothèses dans l’évaluation du monde réel.
Les hypothèses relatives aux signaux de sécurité ou à la réutilisation sont généralement présentées ou générées à partir des résultats obtenus à partir d’une source de données ou d’un type d’analyse de l’information. Nous avons l’intention d’aller plus loin en développant des approches qui combineront différents types/sources d’information pour la recherche de génération d’hypothèses à partir de données du monde réel.
Utilisation et efficacité : Rester concentré, rester global.
L’évaluation des médicaments et des déterminants de la santé est plus efficace lorsqu’elle se concentre sur un seul médicament ou un seul soin. L’inconvénient est de perdre de vue l’environnement global des soins (alternatives thérapeutiques ; trajectoires de soins). Nous avons l’intention de développer des recherches qui contextualiseront et caractériseront de manière plus approfondie l’utilisation globale des soins de santé autour de recherches ciblées sur l’utilisation ou l’efficacité d’un médicament ou d’un soin donné.
Politiques et impact : Évaluer l’impact des mesures réglementaires sur la santé publique.
En fin de compte, les hypothèses générées/confirmées dans les deux premiers axes de recherche peuvent aboutir à des recommandations officielles ou à des actions réglementaires visant à optimiser les stratégies de santé. Notre recherche évaluera ici dans quelle mesure celles-ci sont adoptées avec succès et bénéfiques pour la santé, complétant ainsi notre parcours de recherche de la génération d’hypothèses à la traduction dans la société.

Publications clés 2021

Altman MC, Rinchai D, Baldwin N, Toufiq M, Whalen E, Garand M, Syed Ahamed Kabeer B, Alfaki M, Presnell SR, Khaenam P, Ayllon-Benitez A, Mougin F, Thebault P, Chiche L, Jourde-Chiche N, Phillips JT, Klintmalm G, O’Garra A, Berry M, Bloom C, Wilkinson RJ, Graham CM, Lipman M, Lertmemongkolchai G, Bedognetti D, Thiebaut R, Kheradmand F, Mejias A, Ramilo O, Palucka K, Pascual V, Banchereau J, Chaussabel D. Development of a fixed module repertoire for the analysis and interpretation of blood transcriptome data. Nat Commun. 2021 Jul 19;12(1):4385. https://doi.org/10.1038/s41467-021-24584-w

Gil-Jardiné C, Chenais G, Pradeau C, Tentillier E, Revel P, Combes X, Galinski M, Tellier E, Lagarde E. Trends in reasons for emergency calls during the COVID-19 crisis in the department of Gironde, France using artificial neural network for natural language classification. Scand J Trauma Resusc Emerg Med. 2021 Mar 31;29(1):55. https://doi.org/10.1186/s13049-021-00862-w

Klann JG, Weber GM, Estiri H, Moal B, Avillach P, Hong C, Castro V, Maulhardt T, Tan ALM, Geva A, Beaulieu-Jones BK, Malovini A, South AM, Visweswaran S, Omenn GS, Ngiam KY, Mandl KD, Boeker M, Olson KL, Mowery DL, Morris M, Follett RW, Hanauer DA, Bellazzi R, Moore JH, Loh NW, Bell DS, Wagholikar KB, Chiovato L, Tibollo V, Rieg S, Li A, Jouhet V, Schriver E, Samayamuthu MJ, Xia Z, Hutch M, Luo Y, Consortium for Clinical Characterization of C-bEHR, Kohane IS, Brat GA, Murphy SN. Validation of an Internationally Derived Patient Severity Phenotype to Support COVID-19 Analytics from Electronic Health Record Data. J Am Med Inform Assoc. 2021 Feb 10;28(7):1411-20. https://doi.org/10.1093/jamia/ocab018

Letinier L, Jouganous J, Benkebil M, Bel-Letoile A, Goehrs C, Singier A, Rouby F, Lacroix C, Miremont G, Micallef J, Salvo F, Pariente A. Artificial intelligence for unstructured healthcare data: application to coding of patient reporting of adverse drug reactions. Clin Pharmacol Ther. 2021 Apr 18;110(2):392-400. https://doi.org/10.1002/cpt.2266

Osman I, Ben Yahia S, Diallo G. Ontology Integration: Approaches and Challenging Issues. Inform Fusion. 2021 Jul;71:38-63. https://doi.org/10.1016/j.inffus.2021.01.007

Ramiz L, Contrand B, Rojas Castro MY, Dupuy M, Lu L, Sztal-Kutas C, Lagarde E. A longitudinal study of mental health before and during COVID-19 lockdown in the French population. Global Health. 2021 Mar 22;17(1):29. https://doi.org/10.1186/s12992-021-00682-8

Chouchana L, Blet A, Al-Khalaf M, Kafil TS, Nair G, Robblee J, Drici M-D, Valnet-Rabier M-B, Micallef J, Salvo F, Treluyer J-M, Liu PP. Features of Inflammatory Heart Reactions Following mRNA COVID-19 Vaccination at a Global Level. Clin Pharmacol Ther. 2022 Mar;111(3):605-13. https://doi.org/10.1002/cpt.2499
Gil-Jardine C, Chenais G, Pradeau C, Tentillier E, Revel P, Combes X, Galinski M, Tellier E, Lagarde E. Surveillance of COVID-19 using a keyword search for symptoms in reports from emergency medical communication centers in Gironde, France: a 15 year retrospective cross-sectional study. Intern Emerg Med. 2022 Mar;17(2):603-8. https://doi.org/10.1007/s11739-021-02818-5

Linard M, Bezin J, Hucteau E, Joly P, Garrigue I, Dartigues J-F, Pariente A, Helmer C. Antiherpetic drugs: a potential way to prevent Alzheimer’s disease? Alzheimers Res Ther. 2022 Jan 7;14(1):3. https://doi.org/10.1186/s13195-021-00950-0

Tournier M, Pambrun E, Maumus-Robert S, Pariente A, Verdoux H. The risk of dementia in patients using psychotropic drugs: Antidepressants, mood stabilizers or antipsychotics. Acta Psychiatr Scand. 2022 Jan;145(1):56-66. https://doi.org/10.1111/acps.13380

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