Biostatistics

The team develops new models and statistical methods for data from epidemiological studies and clinical trials, with a strong emphasis on cohort data analysis.

Objectives

The Biostatistics team develops statistical methods for the analysis of data from epidemiological studies or clinical trials. The major area of research focuses on dynamic models, i.e. all the models to take into account the temporal dimension of events and processes. Some works have a strong theoretical dimension but they are all motivated by applications for natural history, risk factors, diagnosis or prognosis of chronic diseases such as Alzheimer’s disease, AIDS, cancer or disease chronic kidney and by the assessment of the impact of these diseases for Public Health. Software that implements these methods are regularly made available to the scientific community via Internet. To support its activities recruitments are planned.

_SJP0146

Details

Centre de recherche INSERM U1219
Université de Bordeaux – ISPED
146 rue Léo-Saignat
33076 BORDEAUX cedex

Tél : +33 (0)5 57 57 13 93
Tél : +33 (0)5 57 57 95 68
Fax : +33 (0)5 56 24 00 81

  • Director :
    Directrice de l’équipe Biostatistique

    University Bordeaux II           HDR                           2002               Biostatistics/Public Health

    University Paris VII                PhD                            1994                Biostatistics

    University Paris VII                Master 2                     1990               Biomathematics

  • Contact : Sandrine Darmigny


Research area

Multivariate models for time-dependent data

  • Joint models for longitudinal markers and multiple events
  • Latent process models
  • Multi-state models
  • Modeling of protracted exposure in case-control studies
  • Evaluation of model assumptions and predictive ability

Model-based estimation of Public Health indicators

  • Projection of dementia burden and impact of intervention
  • Estimation of HIV infection from several sources of data


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Main publications

  1. Commenges D and Jacqmin-Gadda H. Dynamical Biostatistical Models. 2015. Ed : CRC Press
  2. Commenges D and Jacqmin-Gadda H. Modèles Biostatistiques pour l’Epidémiologie. 2015. Ed : De Boeck
  3. Blanche P, Proust-Lima C, Loubère L, Dartigues JF, Jacqmin-Gadda H. Qantifying and comparing dynamic predictive accuracy of joint models for longitudinal marker and time-to-event in presence of censoring and competing risk events, Biometrics 2015, 71,102-113
  4. Joly P,Touraine C, Georget A, Dartigues JF, Commenges D, Jacqmin-Gadda H. Prevalence projections of chronic diseases and impact of public health intervention, Biometrics, 2013;69: 109–117.
  5. Rondeau, V., Mazroui, Y., & Gonzalez, J. R. (2012). frailtypack: an R package for the analysis of correlated survival data with frailty models using penalized likelihood estimation or parametrical estimation. Journal of Statistical Software, 47(4), 1-28.

Members


  • Ahmadou Alioum
    Professeur des Universités en Biostatistique
    Directeur-Adjoint de l’ISPED en charge des Etudes

    Parcours

    Depuis 2006- : Professeur des Universités en Biostatistique, ISPED, Université de Bordeaux

    1995-2006 : Maître de Conférences en Biostatistique, ISPED, Université Bordeaux Segalen

    1991-1995 : Assistant associé en Biostatistique et Informatique Médicale, Université de Bordeaux II

     

    Titres et diplômes

    2004 :   Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) – Biostatistique

    1994 :    Doctorat de l’Université de Bordeaux 2 (Très Honorable avec Félicitations du Jury)

                    Mention Sciences Biologiques et Médicales, Spécialité Biostatistique

    1990 :    DESS de Mathématiques Appliquées, Université Paris 6 (A. Bien)

    1989 :    Maitrise d’Ingénierie Mathématique, Université de Bordeaux I

    1988 :    Licence de Mathématique, Université de Bordeaux I

     

  • Marta Avalos
    MdC Biostatistique

    Parcours

     Education

    2004 PhD Information and Systems Technologies, Technology Univ., Compiègne.

    2001 MD Public Health, Paris-Sud Univ., Orsay.

    2000 MD Mathematics, Barcelona Univ., Barcelona (Spain).

    Position

    2005 – Assistant professor with tenure (Maître de Conférences), Bordeaux Univ., Bordeaux, ISPED.

    2004 – 2005 Assistant lecturer (ATER), Paris Diderot Univ., Paris.

    2001 – 2004 PhD student (Allocataire de recherche), Compiègne Technology Univ., Compiègne.

  • Sebastien Branchoux
    PhD student

    Education

    Since October 2017 – PhD Student in Public Health (ISPED) –  Surrogate end points of overall survival for metastatic cancer patients treated by immune-checkpoint inhibitors (Director: Virginie Rondeau & Carine Bellera)

    2007-2009 – Master degree in Applied Statistics and Modelization, Montpellier University of Sciences

    2006-2007 – GCE “A” levels in Biology, Montpellier University of Sciences.

  • Daniel Commenges
    Directeur de Recherche Emérite

    Parcours

    École Nationale des ponts et Chaussées (1972)

    Doctorat en Mathématiques Appliquées, Bordeaux (1980)

    Habilitation à diriger des recherches, Bordeaux (1988)

  • Sandrine Darmigny
  • Florian Guillet
    Ingénieur d’étude biostatisticien
    • Ingénieur d’étude biostatisticien dans l’équipe Biostatistique depuis septembre 2017
    • Formations : 
      • Master 2 de Santé PubliqueSpécialité Biostatistique
        ISPED, Université de Bordeaux
        2016 – 2017
      • Master 1 de Santé Publique
        ISPED, Université de Bordeaux
        2015 – 2016
      • Licence Professionnelle Statistique et Informatique pour la Santé
        IUT de Vannes, Université de Bretagne Sud
        2014 – 2015
      • Licence Mathématiques-Economie
        Université de Rennes I
        2012 – 2014
  • Pierre Joly
    Maître de Conférences
  • Agnieszka Krol
    Doctorante

    Parcours

    Depuis 2013 –  Doctorat en Biostatistique.
    Sujet de thèse: Prise en compte des évènements multiples pour analyser et prédire l’évolution d’un cancer.
    Directrice Virginie Rondeau, co-directeur Stefan Michiels (Gustave Roussy)

    2011 – 2013 – Master en Mathématiques. Université Technique de Gdansk, Pologne

  • Karen Leffondre
    Associate Professor (Maître de Conférences)

    Education (main degrees)

    • 1994: BSc equivalent in Statistics and Econometrics, Vannes Institute of Technology and Rennes 1 University

    • 1996: MSc in Public Health (Biostatistics stream), Paris-Sud University.

    • 1999: PhD in Biostatistics, Paris-Sud University // Inserm U1018 (Biostatistics team).

    • 2014: Habilitation (HDR, French degree of accreditation to supervise PhD students), University of Bordeaux.

    Appointments (main affiliations)

    • 1999-2003: Post-doc, McGill University (Dep. of Epidemiology and Biostatistics) // Research Centre of the MUHC (Division of Clinical Epidemiology).

    • 2003-2008: Assistant Professor, University of Montreal (Dep.of Social and Preventive Medicine) // Research Centre of the CHUM (Risks to Health Axis).

    • 2008-present: Associate Professor (“Maître de conférences”), University of Bordeaux (Bordeaux School of Public Health, ISPED) // Inserm UMR 1219 (Biostatistics team).

    Current awards and recognitions

    • 2013-2017: Scientific excellence award (“PES”), Bordeaux Segalen University (with external reviewers from mathematics sections).

    • 2015: Promotion to the rank of “Maître de conférences hors classe”, French National Board of Universities (CNU), section 26 (Applied mathematics and applications of mathematics).

    • 2015: Qualification to apply for a full Professor position (“Qualification aux fonctions de professeur des universités”), CNU section 26.

    • 2017-2021: Award for doctoral research supervision (“PEDR”), CNU section 26
  • Emilie Leveque
    Doctorante

    Parcours:

    • Depuis Janvier 2015: Doctorat en Santé Publique option Biostatistique

          “Évaluation de modèles statistiques pour étudier l’impact des
           expositions prolongées environnementales/professionnelles  sur le risque de cancer”

    • Novembre 2013-Décembre 2015: Ingénieure Biostatisticienne dans l’équipe Biostat
    • Avril 2013-Octobre 2013: Stage ingénieur dirigé par Virginie Rondeau: “La pollution influence-t-elle les sorties SMUR pour pathologies cardio-vasculaires ?”
    • 2008-2013 : INSA Rouen , Spécialité : Génie Mathématiques

     

  • Viviane Philipps
    Ingénieur d’étude

    Parcours

    Depuis 2012 Ingénieur d’étude biostatisticienne – INSERM U897, Equipe Biostatistique.
    2012 Master de Mathématiques Appliquées, Spécialité Statistique – Université de
    Strasbourg.

  • Cécile Proust-Lima
    Researcher in Biostatistics

    Education

    2014 HDR (Habilitation to conduct research), Univ. Bordeaux, France.
    2006 PhD in Biostatistics, Univ. Bordeaux Segalen, France.
    2003 Master degree in Epidemiology and Public Health, ISPED, Univ. Bordeaux Segalen, France.
    2002 Master degree in Biostatistics, National School for Statistics and Information Analysis, ENSAI, Rennes, France.

     

  • Virginie Rondeau
    Directeur de Recherche INSERM
    PhD in Biostatistics

    Parcours

    2008, HDR (Hability to conduct Research), France.

    2001, Post-Doctorat at USC University, U.S.A.

    2000, PhD in Biostatistics (University of Bordeaux), France.

  • Anaïs Rouanet
    Doctorante en Biostatistique

    Ecole d’ingénieur Centrale Marseille

    Master B3S à Lyon (bio-statistique, bio-mathématique, bio-informatique)

     

  • Denis Rustand
    Ph.D. student

    [2017 – 2020] : PhD in biostatistics (ISPED, Bordeaux).

    [2015 – 2017] : Master of statistical modeling and data science (UBS, Vannes).

     

    Thesis : Joint models development for therapeutic choice evaluation in advanced cancer.

    Thesis supervisors :

    • Virginie Rondeau, director of research in Biostatistics at the INSERM institute, ISPED, Bordeaux
    • Laurent Briollais, senior investigator (biostatistician and statistical geneticist), Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Toronto

     

    Contact : denis.rustand@u-bordeaux.fr // denis@rustand.fr

  • Camille Sabathé
    PhD student Biostatistics
    • Since oct 2016 : PhD in Public Health. Major: Biostatistics, supervised by Pierre Joly. INSERM U1219 Bordeaux Population Health Research Center, Biostatistics team and Univ. Bordeaux, France.
    • 2014 – 2016 : MSc in Public Health. Major: Biostatistic. Univ. Bordeaux, France.
    • 2011 – 2014 : BSc in Applied Mathematics and Social Sciences. Minor: cognitive science. Univ. Bordeaux, France.
    • 2011 : High School Diploma. Economics and Social Science (ES). Lycée Jean Monnet, Blanquefort.
  • Corentin Segalas
    Doctorant en biostatistique, 2ème année.
    • Doctorat en santé publique, Spécialité biostatistique
      INSERM U1219 Bordeaux Population Health, équipe biostatistique
      Université de Bordeaux
      octobre 2016 – présent
    • Master de mathématiques appliquées, Spécialité probabilités et statistiques
      Université de Bordeaux
      2014 – 2016
    • Licence de mathématiques, Spécialité mathématiques fondamentales
      Université de Pau et des Pays de l’Adour et Université de Bordeaux
      2011 – 2014
    • Baccalauréat scientifique, Spécialité mathématiques
      Lycée Louis Barthou, Pau
      2011
  • Casimir Ledoux Sofeu
    PHD-student
    - PHD-student in biostatistic at the university of Bordeaux, ISPED since october 2016. Supervisor: Virginie Rondeau
    - Master degree in Public health, specialty "Méthodes Quantitatives et Econométriques pour la Recherche en Santé", Aix-Marseille University, France, 20114-2016
    -Data manager at the Department of Epidemiology and Public health, Centre Pasteur du Cameroun, 2011-2016
    - Master degree in Computer science, University of yaounde I, Cameroon,  2008-2011
    - Bachelor's Degree in Mathematics and Computer Science, Specialty Basic Computer Science, University of Dschang , Cameroon,2005-2008
    - Baccalauréat C, Mathematics and Physical Sciences, Bamendjou High School, Cameroon, 2005
  • Bachirou Taddé
    PhD Student

    Depuis 2015 :
    Doctorat en santé publique, Spécialité biostatistique
    Laboratoire : INSERM U1219 Bordeaux Population Health,
    Bordeaux, France
    2014-2015 :
    Master II  Modélisation Statistique et Stochastique, Université de Bordeaux, France.
    2013-2014 :
    Master I Modélisation mathématique et statistique, spécialité Modélisation Statistique et Stochastique, Université de Bordeaux.
    2012-2013 :
    Licence Professionnelle en Statistique et Économétrie, Abomey-calavi, Bénin
    2008-2011 :
    Diplôme d’Ingénieur d Conception en Informatique à l’Ecole Polytechnique d’Abomey-Calavi,  Abomey-calavi, Bénin
    2006-2008 :   Classes préparatoires aux grandes écoles d’ingénieurs.
    2005-2006 :   Baccalauréat scientifique, option Sciences Mathématiques.

  • Maude Wagner
    PhD Student

    Education

    2016-19 PhD Student in Biostatistics, University of Bordeaux, France

    Thesis title: Modeling of lifestyle trajectories and dynamic relationships with biomarkers of the pathological cascade of Alzheimer’s disease

    SupervisorsCécile Proust-Lima – Biostatistics team, Inserm U1219, Bordeaux

                         Cécilia Samieri – Lifelong Exposures, Health and Aging (LEHA) team, Inserm U1219, Bordeaux

     2014-16 Master’s degree in Biostatistics and Public Health, ISPED, University of Bordeaux, France

    › 2011-14 License of Mathematics Applied to Social Sciences, University of Bordeaux, France

     

     

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